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基于无细胞体系的生物合成代谢模块设计、构建与快速途径原型
唐士茗, 胡纪元, 郑穗平, 韩双艳, 林影
合成生物学    2022, 3 (6): 1250-1261.   DOI:10.12211/2096-8280.2022-024
摘要   (1121 HTML148 PDF(pc) (1932KB)(813)  

随着代谢工程及合成生物学技术的发展,化学品高效生物合成与绿色制造成为可能。高效生物合成体系的设计与构建是绿色生物制造的核心,其理论体系建立及关键技术突破,将为实现绿色生物制造领域高效生产及资源与环境可持续发展提供有力支撑。本文借助代谢途径模块设计的案例,探讨化合物生物合成过程中潜在通用模块设计原则、设计工具,以及基于无细胞蛋白合成体系的代谢模块快速构建及测试的方法,将突破生物合成途径多基因、多模块“设计-构建-测试”(Design-Build-Test cycle,DBT cycle)高效循环迭代的技术瓶颈。结合机器学习方法的应用,将使“设计-构建-测试”向“设计-构建-测试-学习”(Design-Build-Test-Learn cycle,DBTL cycle)进一步延伸,对高效合成模块的“精准-鲁棒性”设计与构建、推动合成生物学科学与技术发展具有重要意义。



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图4 酵母萜类合成模块设计及代谢途径快速原型
正文中引用本图/表的段落
林影课题组在建立高效毕赤酵母CFPS技术基础上,针对萜类化合物合成复杂代谢途径进行模块化设计,搭建萜类合成模块及代谢途径快速原型体系,研究各合成模块间的匹配性及通用性,探讨萜类合成模块化设计原则,为毕赤酵母萜类合成底盘细胞构建提供基础(数据未发表),见图4。
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