合成微生物群落研究进展

曲泽鹏, 陈沫先, 曹朝辉, 左文龙, 陈业, 戴磊

Research advances in synthetic microbial communities

Zepeng QU, Moxian CHEN, Zhaohui CAO, Wenlong ZUO, Ye CHEN, Lei DAI

表1 微生物相互作用类型的研究案例

Table 1 Examples of different types of microbial interactions.

相互作用类型 研究案例 互利共生（+/+） Shou等人通过构造营养互补的酵母菌群，来研究微生物群落的协同作用[18]。 Summers等人发现缺乏种间氢交换的突变体金属还原硫杆菌（Geobacter metallireducens）和代谢乙醇的硫还原硫杆菌（Geobacter sulfurreducens）共培养时，加速了导电聚集体的形成[19]。 偏利共生（+/0） Freilich等人根据118个物种的代谢模型预测相互作用，发现合作是普遍存在的，但往往是单向的偏利共生[20]。 Kedia等人发现，在与酵母株混合培养中，酵母代谢为罗伊氏乳杆菌（L. reuteri）提供了必需的营养物质，促进其生物量的增加[21]。 Lu等人利用双歧杆菌产生乙酸抑制酵母生长，被用于新型非乳制品发酵饮品的设计[22]。 寄生或捕食（+/-） Francisco等人报道了黄色粘球菌（Myxococcus xanthus）利用铜离子杀死苜蓿中华根瘤菌（Sinorhizobium meliloti）[23]。 Zhang等人利用细菌追踪技术在单细胞水平上研究了黄色粘球菌（Myxococcus xanthus）对大肠杆菌的捕食动力学[24]。 竞争（-/-） Gadaga等人发现乳酸菌在于酵母菌进行共培养时，存在相互的拮抗作用，酵母菌通过产生有机酸来抑制乳酸菌的生长[25]。 Gause在做共培养实验时，发现了一系列生长相互抑制的物种组合，认为具有相同生态位的菌株在生长上存在竞争排斥现象[26]。