| 哺乳动物细胞 | 2个间隔区通过天然CRISPR序列自我加工 | 2个靶标(1个基因) | 对1个靶基因敲除，效率为1.6% | [4] |
| 酿酒酵母 | Casy4核酸酶加工 | 3个基因 | 同时对3个不同启动子进行激活，使得3个报告基因荧光强度提升了2倍 | [113] |
| 酿酒酵母 | 基于Csy4核酸酶加工的多gRNA快速组装 | 12个靶标(3个基因) | 通过12个gRNA靶向使得3个报告基因荧光强度分别被抑制了92%、81%和95% | [114] |
| 酿酒酵母 | 基于tRNA转录本切割机制的多gRNA表达系统 | 8个基因 | 通过两轮8个基因的敲除获得了30倍的游离脂肪酸产量 | [115] |
| 酿酒酵母 | 多个gRNA表达盒通过pol Ⅲ启动子启动 | 3个基因 | 将适配子与gRNA融合进行多基因调控，获得了不同的紫罗兰素生物合成产物 | [118] |
| 酿酒酵母 | 基于Csy4核酸酶加工的多gRNA快速组装策略及多Cas9正交组合调控 | 3个基因 | 通过组合调控使两个报告基因表达分别被抑制和激活5倍，同时以95%的效率敲除第三个基因 | [119] |
| 酿酒酵母 | 通过质粒表达多个gRNA表达盒以及截短gRNA用于调控 | 3个基因 | 通过对三个基因分别进行编辑、激活和抑制获得了α-檀香烯2.66倍的产量 | [43] |
| 马克思克鲁维酵母(Kluyveromyces marxianus) | 基于tRNA转录本切割机制的多gRNA表达系统 | 6个靶标(4个基因) | 通过对4个基因进行调控，使乙酸乙酯的产量提升了3.8倍 | [120] |
| 大肠杆菌 | 多个gRNA表达盒通过质粒表达 | 3个基因 | 通过对3个基因进行组合调控得到了2.3倍苹果酸产量菌株 | [121] |
| 大肠杆菌 | 多个gRNA表达盒通过质粒表达 | 3个基因 | 对苹果酸合成途径基因进行组合调控后获得了2.3倍苹果酸产量菌株 | [121] |
| 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) | 多个gRNA表达盒整合至基因组 | 3个基因 | 通过多基因动态组合调控提高了N-乙酰葡糖胺产量 | [122] |
| 天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor) | 多个gRNA表达盒与dCas9在质粒上表达 | 4个基因 | 通过对4个靶基因同时进行抑制，使其mRNA表达量降为对照的2%～32% | [123] |