| 1e4w | SHFNEYE | 8 | 8 | TGF-α抗原表位类似物，与tAb2抗体结合 | 381 | 酰胺键 |
| 1sfi | GRCTKSIPPICFPD | 14 | 14 | 胰蛋白酶抑制剂 | 612 | 酰胺键 |
| 2axi | PFE[6cw]LDWEFp | 10 | 10 | P53-HDM2配体 | 510 | 酰胺键 |
| 3av9 | SAKIDNLD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 397 | 酰胺键 |
| 3ava | ALKIDNLD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 395 | 酰胺键 |
| 3avb | SLKIDNLD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 401 | 酰胺键 |
| 3avf | DLKIDNLD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 418 | 酰胺键 |
| 3avg | ADKIDNLD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 385 | 酰胺键 |
| 3avh | ARKIDNLD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 388 | 酰胺键 |
| 3avi | SLKIDNMD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 432 | 酰胺键 |
| 3avj | ALKIDNMD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 437 | 酰胺键 |
| 3avk | SLKIDNED | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 419 | 酰胺键 |
| 3avm | SRKIDNLD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 402 | 酰胺键 |
| 3avn | SHKIDNLD | 8 | 8 | HIV整合酶重组抑制剂 | 394 | 酰胺键 |
| 3wne | PKIDNG | 6 | 6 | HIV整合酶天然配体 | 378 | 酰胺键 |
| 3wng | PKIDNp | 6 | 6 | HIV-1整合酶抑制剂 | 360 | 酰胺键 |
| 3wnh | PK[nle]DNv | 6 | 6 | HIV-1整合酶抑制剂 | 367 | 酰胺键 |
| 3zgc | GDEETGE | 7 | 7 | 红细胞核因子配体 | 343 | 酰胺键 |
| 4k1e | GFCQRSIPPICFPD | 14 | 14 | 胰蛋白酶抑制剂 | 605 | 酰胺键 |
| 4kel | GFCQRSIPPICFPN | 14 | 14 | 胰蛋白酶抑制剂 | 609 | 酰胺键 |
| 4y1d | K[nle]DNv[45w] | 6 | 6 | HIV-1整合酶抑制剂 | 412 | 酰胺键 |
| 5n99 | NQpWQ | 5 | 5 | 链霉亲和素配体 | 371 | 酰胺键 |
| 5xn3 | RGDINNNV | 8 | 8 | SPSB2-iNOS相互作用抑制剂 | 270 | 酰胺键 |
| 6jwm | RGDINNN | 7 | 7 | SPSB2-iNOS相互作用抑制剂 | 281 | 酰胺键 |
| 6jwn | RGDINNNVE | 9 | 9 | SPSB2-iNOS相互作用抑制剂 | 294 | 酰胺键 |
| 7k2e | GDEETGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 360 | 酰胺键 |
| 7k2g | GDEEAGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 403 | 酰胺键 |
| 7k2h | GDPETGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 343 | 酰胺键 |
| 7k2m | GEPETGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 320 | 酰胺键 |
| 6xbe | rrLcPVPE | 8 | 8 | NDM-1金属-β-内酰胺酶抑制剂 | 379 | 酰胺键 |
| 6xbf | rrLcPIPE | 8 | 8 | NDM-2金属-β-内酰胺酶抑制剂 | 452 | 酰胺键 |
| 1hqq | RCCHPQCGAVEEC | 13 | 11 | 链霉亲和素配体 | 413 | 二硫键 |
| 1jbu | EEWEVLCWTWETCER | 15 | 7 | 凝血因子Ⅶ抑制剂 | 908 | 二硫键 |
| 1smf | CTKSIPPEC | 9 | 9 | 胰蛋白酶抑制剂 | 414 | 二硫键 |
| 1sle | CHPQGPPC | 8 | 8 | 链霉亲和素配体 | 324 | 二硫键 |
| 1vpp | RGWVEICAADDYGRCLTE | 18 | 9 | 生长素抑制剂 | 556 | 二硫键 |
| 1vwb | CHPQFC | 6 | 6 | 链霉亲和素配体 | 306 | 二硫键 |
| 2ck0 | CKEWLSTAPCG | 11 | 10 | 血管紧张素Ⅱ抗体结合肽 | 504 | 二硫键 |
| 2nwn | CSWRGLENHRMC | 12 | 12 | 丝氨酸蛋白酶抑制剂 | 597 | 二硫键 |
| 3g5v | CGADSYEMEEDGVRKC | 16 | 16 | EGFR肽段 | 603 | 二硫键 |
| 3p72 | CTERMALHNLC | 11 | 11 | 血小板糖蛋白1b抑制剂 | 521 | 二硫键 |
| 3wnf | CKIDNC | 6 | 6 | HIV-1整合酶抑制剂 | 432 | 二硫键 |
| 4ib5 | GCRLYGFKIHGCG | 13 | 11 | CK2beta拮抗剂 | 456 | 二硫键 |
| 4m1d | CRIHIGPGRAFYTC | 14 | 14 | HIV-1 gp120蛋白V3域类似物 | 588 | 二硫键 |
| 4ou3 | CNGRCG | 6 | 5 | 猪氨肽酶N抑制剂 | 366 | 二硫键 |
| 5djc | DCAWHLGELVWCT | 13 | 11 | 抗体结合肽 | 610 | 二硫键 |
| 5co5 | GCCSHPACAGNNQHIC | 16 | 15 | 芋螺毒素 | 692 | 二硫键 |
| 5eoc | CQLINTNGSWHIC | 13 | 13 | 丙型肝炎病毒E2表位Ⅰ类似物 | 468 | 二硫键 |
| 5h5q | CRVDLQGWRRCRR | 13 | 11 | 人源GPX4抑制剂 | 505 | 二硫键 |
| 5th2 | CQFDQSTRRLKC | 12 | 12 | L5Q中间位变体类似物 | 709 | 二硫键 |
| 5vb9 | CWVLEYDMFGALHCR | 15 | 14 | IL-17抗体抑制剂 | 571 | 二硫键 |
| 5wxr | GACSARGLENHAAC | 14 | 12 | 尿激酶型纤溶酶原激活物抑制剂 | 526 | 二硫键 |
| 5xco | RRRRCPLYISYDPVCRRRR | 19 | 11 | K-Ras(G12D突变体)抑制剂 | 650 | 二硫键 |
| 6e5m | CTKSIPPQC | 9 | 9 | β-胰蛋白酶抑制剂 | 434 | 二硫键 |
| 1bm2 | [slz][pY]VNVP | 6 | 6 | GBR2-sh2结构域高活性配体 | 336 | 其他环化 |
| 1bzh | DADE[flt]L[aea] | 7 | 7 | 酪氨酸磷酸酶抑制剂 | 398 | 其他环化 |
| 1vwl | HPQGPPC([lea])K | 9 | 8 | 链霉亲和素配体 | 300 | 其他环化 |
| 4zjx | C[dab]RWTKCL | 8 | 7 | 肉毒杆菌神经毒素（血清型A）抑制剂 | 604 | 其他环化 |
| 5nes | cWwKkKkKwWc[8vh] | 12 | 12 | 靶向铜绿假单胞菌糖蛋白的抗菌肽 | 259 | 其他环化 |
| 5ney | CwWkKkKkWwC[oxe] | 12 | 12 | 靶向铜绿假单胞菌糖蛋白的抗菌肽 | 271 | 其他环化 |
| 5nf0 | cWwKkKkKwWc[oxe] | 12 | 12 | 靶向铜绿假单胞菌糖蛋白的抗菌肽 | 283 | 其他环化 |
| 6b67 | M[pS]I[pY]VA[48v] | 7 | 7 | PPM1A活性调节剂 | 528 | 其他环化 |
| 6dn6 | INNN[abu] | 5 | 5 | iNOS-SPSB蛋白-蛋白相互作用抑制剂 | 234 | 其他环化 |
| 6dn7 | WDINNN[bal] | 7 | 7 | iNOS-SPSB蛋白-蛋白相互作用抑制剂 | 254 | 其他环化 |
| 6dn8 | [gzj]VDINNN[cy3] | 8 | 8 | iNOS-SPSB蛋白-蛋白相互作用抑制剂 | 258 | 其他环化 |
| 6nnv | F[mea][9kk][sar]DV[mea]Y[sar]WYLCK | 14 | 13 | PD-L1抑制剂 | 510 | 其他环化 |
| 6u4a | WWIIP[aly]VK[aly]GC | 11 | 11 | BRD2-BD1抑制剂 | 587 | 其他环化 |
| 6u74 | WKTI[aly]G[aly]TWRT[aly]QC | 14 | 14 | BRD2-BD1抑制剂 | 582 | 其他环化 |
| 6u8m | W[aly]KAILPG[aly]ILKTLHIC | 17 | 17 | BRD2-BD1抑制剂 | 504 | 其他环化 |
| 6wgn | GyFVNFRNFRTFRCG | 15 | 14 | K-Ras(G12D突变体)抑制剂 | 641 | 其他环化 |
| 6xci | cP[lwi][hyp]Epk[nle] | 8 | 8 | NDM-3金属-β-内酰胺酶抑制剂 | 457 | 其他环化 |
| 6xib | [b74]CKG[ftr][ftr]DHY[3wx]CA | 12 | 11 | PCSK9抑制剂 | 546 | 其他环化 |
| 6xic | [b74]CKa[ftr][ftr]DHY[3wx][dhl] | 11 | 11 | PCSK9抑制剂 | 518 | 其他环化 |
| 6xid | [v7m]CKa[ftr][ftr]PTY[3wx]CA | 12 | 11 | PCSK9抑制剂 | 537 | 其他环化 |
| 6xie | [b74]CAa[apd][ftr]QT[0a1][3wx]C | 11 | 11 | PCSK9抑制剂 | 496 | 其他环化 |
| 6xif | [v7s]GAa[apd][v7p][gnc][olt][0a1][3wx]G | 11 | 11 | PCSK9抑制剂 | 528 | 其他环化 |
| 6xs5 | [48v]yIIDTPLGVFLSSLKR | 17 | 17 | 人源Vps29抑制剂，结构稳定剂 | 529 | 其他环化 |
| 6xs7 | [48v]yTTIYWTPLGTFPRIR | 17 | 17 | 人源Vps30抑制剂，结构稳定剂 | 654 | 其他环化 |
| 6xs8 | [48v]yGYDPLGLKYFA | 13 | 13 | 人源Vps31抑制剂，结构稳定剂 | 380 | 其他环化 |
| 6xsa | [48v]YLPTITGVGHLWHPL | 15 | 15 | 人源Vps32抑制剂，结构稳定剂 | 623 | 其他环化 |
| 6yw1 | [48v]yVWLTDTWVLSRT | 14 | 14 | 促进HIF脯氨酰羟化酶2结晶的环肽配体 | 671 | 其他环化 |
| 7bph | yFESVYAIWGTLCG | 14 | 13 | GNAS抑制剂 | 520 | 其他环化 |
| 7k2k | [bal]DEETGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 349 | 其他环化 |
| 7k2l | [bal]NPETGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 330 | 其他环化 |
| 7k2o | [abu]DPETGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 346 | 其他环化 |
| 7k2p | [dav]DPETGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 344 | 其他环化 |
| 7k2r | [b3a]DPETGE | 7 | 7 | 人源KEAP1蛋白抑制剂 | 350 | 其他环化 |
| 7rov | A[060]PLYISYDPVCRA | 14 | 12 | K-Ras(G12D突变体)抑制剂 | 564 | 其他环化 |