合成生物学视角下的基因功能探索与酵母工程菌株文库构建

章益蜻, 刘高雯

Gene function exploration and engineering strain library construction from a synthetic biology perspective

Yiqing ZHANG, Gaowen LIU

图1 经典文库构建方法示意图 （本图由biorender绘制） （a）基因缺失文库中，目的基因ORF（橘色片段）被替换成卡那霉素抗性筛选标签KanMX（黄色片段），两侧伴有“分子条形码”barcode（蓝色片段）。Chr.DNA：染色体DNA。（b）Bar-seq原理示意图。在特定条件处理下，目标菌株（红色）的生长量相对低（淡粉色），表现为测序时相应barcode的读数量相对低（红色线条比其他颜色少）。（c）基因过表达文库中，目的基因ORF（橘色片段）除了在基因组上正常表达之外，还额外在质粒上由通用型启动子（淡绿色片段）驱动表达。（d）ORF-Tag文库中，在删除终止密码子的目的基因ORF（橘色片段）C端插入荧光蛋白GFP（深绿色片段）和筛选标签KanMX（黄色片段）。Chr.DNA：染色体DNA。

Fig. 1 Schematics of classical library construction method (created by biorender)