抗性基因标记 | Hygromycin (hyg) | Hph (编码潮霉素磷酸转移酶), 具有潮霉素抗性 | A. niger[42],A. fumigatus[43]等 本课题组各种海洋来源菌株 |
| phosphinothricin (bar) | Bar (编码磷化麦黄酮乙酰转移酶),具有草胺膦抗性 | Myceliophthora thermophila[44], Beauveria bassiana[45]等 |
| Carboxin (cbx) | 点突变的SdhB (编码琥珀酸脱氢酶)可作为米曲霉的筛选标记,以醋酸盐作为碳源,可提高对萎锈灵的敏感性 | A. oryzae[46]等 |
| Neomycin (neo) | Neo (编码氨基糖苷磷酸转移酶),具有G418 (新霉素衍生物)抗性 | Phytophthora sojae[47], M. thermophila[48]等 |
| Pyrithiamine (ptrA) | 点突变的PtrA (编码硫胺素噻唑合成酶基因),具有吡啶硫胺抗性 | A. oryzae[49],A. flavus[50]等 |
| Chlorimuron (sur) | Sur (乙酰乳酸合成酶)具有氯嘧磺隆抗性 | Knufia petricola[51]等 |
| Fenhexamid (Fenr) | 点突变的 ERG27 (编码酮还原酶),具有环酰菌胺抗性 | Botrytis cinerea[52]等 |
| Nourseothricin (Nat) | Nat (编码N-乙酰转移酶),具有诺尔斯菌素抗性 | B. cinerea[52]等 |
营养缺陷型标记 | amdS | 带有amdS基因的菌株在以乙酰胺为唯一氮源的培养基上能够正常生长 | A. niger[53], M. thermophila[48]等 |
| niaD | niaD功能缺陷突变株能够耐受高浓度氯盐 | A. oryzae[49]等 |
| pyrG | pyrG功能缺失的突变株只能在含有尿苷或尿嘧啶的培养基上正常生长 | A. niger[42], A. terreus[54]等 |
| argB | argB功能缺失的突变株只能在含有精氨酸的培养基上正常生长 | A. nidulans[55],A. oryzae[56]等 |
| adeA | adeA功能缺失的突变株只能在含有腺苷酸的培养基上正常生长 | A. oryzae[56]等 |
| ppt1 | 缺失ppt1功能的突变体只能在添加赖氨酸的培养基上正常生长 | F. fujikuroi[57]等 |
表型报告基因 | fcc1 | fcc1基因的破坏可导致紫色色素的积累 | F. fujikuroi[57]等 |
| wA | wA突变体形成白色分生孢子 | A. oryzae[49],A. nidulans[55]等 |
| yA | yA突变体形成黄色分生孢子 | A. oryzae[49], A.nidulans[55]等 |
| fwnA | fwnA突变体形成白色分生孢子 | A. niger[58]等 |
| albA | albA突变体形成白色分生孢子 | A. niger[53]等 |
| pkaC | pkaC (编码camp依赖性蛋白激酶的催化亚单位)的破坏可导致平板上的菌落直径大大减小 | A. niger[53]等 |
| creA | creA 敲除菌株产孢能力显著降低 | Spiromastix sp. [59]等 |
| pksP | pksP敲除菌落具有明显的附白化表型 | A. fumigatus[60]等 |
| cnaA | cnaA功能障碍导致菌丝生长缺陷显著,菌落表型非常小而密集 | A. fumigatus[60]等 |
| ayg1 | ayg1 敲除可导致孢子的颜色从黑色变为黄色 | A. carbonarius[61]等 |
| cbh1 | 破坏cbh1将导致SDS-PAGE凝胶上的主要条带丢失,从而有利于通过成功的基因编辑鉴定菌株 | Trichoderma reesei[62]等 |