温艳华, 刘合栋, 曹春来, 巫瑞波

合成生物学 2025, 6 (1): 65-86. DOI:10.12211/2096-8280.2024-061

摘要（1556）

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蛋白质工程，通过定向进化、半理性或理性设计、计算机辅助设计等手段，实现对蛋白质特定功能的设计和改造，获得的工程化蛋白质在食品、医药、能源、材料等行业具有重要的应用价值。在医药化工领域，工程化酶可作为化学原料药及其中间体合成的高效生物催化剂，实现医药工业绿色制造。在生物制药领域，多肽或蛋白修饰酶的改造可显著提升候选药物的制备效率，诊断酶的改造则可以大幅增强检测的准确性和灵敏度。此外，蛋白质工程在提升治疗性酶和治疗性抗体等生物制剂的生物活性、增强药物稳定性、降低免疫原性等方面也发挥重要作用，从而提高药物的可开发性、安全性和有效性。因此，本文简要回顾了蛋白质工程的发展历程，具体阐述了其在化学原料药合成和生物制药两大产业中的一系列应用实例，旨在剖析蛋白质工程在科技成果转化及医药产业应用中存在的问题与挑战，并展望医药产业中蛋白质工程的未来发展方向，以期为促进产学研一体化发展提供借鉴。

Merck和Codexis于2022年报道了一项开创性的工作，通过定向进化获得了一系列青霉素G酰化酶（penicillin G acylase，PGA）突变体，实现了胰岛素特定位置的修饰，可以方便地获得各种胰岛素类似物候选药物［113］（图5）。大肠杆菌来源的PGA催化肽链上N-苯乙酰水解的活性较低，不能满足特定位点保护和解除保护的需求。团队通过筛选发现来源于Kluyvera cryocrescens的KcPGA对A1，B1，B29-苯乙酰基胰岛素的A1、B1、B29位苯乙酰基均有水解能力，当反应时间足够长时，3个苯乙酰基均会被水解。此外，KcPGA对3个位置表现出水解速率差异，B29>A1>B1，这说明通过酶改造实现胰岛素的位置特异性修饰具有可行性。之后通过定向进化获得的一套工具酶实现了胰岛素特定位置的选择性保护和脱保护，得到了A1、B1和B29三个位置分别具有苯乙酰基保护或未保护的共8种中间体。这个苯乙酰基胰岛素工具箱可以作为基础模块合成由胰岛素衍生的候选药物分子，缩短了合成路线，提高了产物的产量和纯度，加速了药物研发进程。此外，作者还证明了工程化的PGA可以耐受其他的酰基供体，也可以拓展至胰高血糖素等其他多肽的生物选择性偶联。