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中药药效成分群的合成生物学研究进展
查文龙, 卜兰, 訾佳辰
合成生物学    2024, 5 (3): 631-657.   DOI:10.12211/2096-8280.2023-082
摘要   (568 HTML60 PDF(pc) (5862KB)(528)  

中药是中华民族的文化瑰宝,也是我国在新药创制领域的重要驱动力。许多中药材来源于稀缺物种,其药效物质的规模化获取困难,是制约中药新药创制研究的重要瓶颈。合成生物学的出现和快速发展为解决这一瓶颈问题提供了新的途径。目前,中药药效物质的合成生物学研究在单个药效分子的生物制备方法上取得了重要进展。中药的药效主要源于多成分作用的叠加和协同,所以药效成分群是中药药效物质的主要形式,然而针对药效成分群的合成生物学研究鲜有报道。建立中药药效成分群合成生物技术的关键是精确调控组成分子的比例,从而产出优质药效成分群。本文首先总结了挥发油、总皂苷、总黄酮、总木脂素、总生物碱等重要类型中药药效成分群形成机制的研究进展。然后,重点以檀香挥发油为例,介绍如何通过酶工程和代谢工程的联合运用实现药效成分群成分比例和产量的双重优化。最后,对中药药效成分群合成生物学领域的未来研究重点进行了展望,包括:(1)加强中药药效成分群生物合成途径解析方面的研究,重点深入阐明复杂药效成分群的形成机制;(2)加强代谢优化手段方面的创新研究,重点揭示未知代谢调控机制并基于此发展创新调控策略;(3)加强酶工程方法学的创新研究,重点发展新型理性设计和定向进化的联用技术以及人工智能辅助的酶工程技术。



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图2 广藿香挥发油成分群的生物合成途径
正文中引用本图/表的段落
广藿香(Pogostemonis Herba)为唇形科植物广藿香[Pogostemon cablin (Blanco) Benth.]的干燥地上部分,具有芳香化浊、和中止呕以及发表解暑等功效。挥发油是其芳香化湿的物质基础[44],也是多种中成药的重要药效成分,例如藿香正气口服液等。药理研究表明,广藿香挥发油还具有抗菌、抗炎以及抗肿瘤等作用[45],主要含有倍半萜化合物广藿香醇(patchouli alcohol)和聚酮化合物广藿香酮(pogostone)。广藿香醇生物合成机制已被阐明。广藿香醇合酶PcPTS催化EE-FPP生成主产物广藿香醇以及其他13个微量倍半萜化合物[图2(a)],包括β-广藿香烯、(+)-吉马烯A、E-β-石竹烯、α-愈创木烯、西车烯、α-蛇麻烯、α-广藿香烯以及γ-广藿香烯等[46]。PcPTS的表达受多个转录因子调控。例如,Chen等[47]发现MYB转录因子家族的PatMYB46可与PatJAZ4结合,显著上调PcPTS的表达;Yu等[48]发现SPL家族的SPL10也可上调PcPTS的表达,从而促进广藿香醇的合成。广藿香酮的生物合成途径目前尚未被完全解析。Wang等[49]采用同位素标记法,证实了4-甲基戊酸是广藿香酮生物合成的前体化合物,并发现PcIBMS1酶在线粒体中可催化4-甲基-2-氧戊酸(4-methyl-2-oxovalerate)和乙酰辅酶A发生aldol缩合,生成2-异丁基苹果酸(2-isobutylmalate),2-异丁基苹果酸通过异构化、脱酸以及与辅酶A相连,生成4-甲基戊酰辅酶A,4-甲基戊酰辅酶A被转运至细胞质,同时失去辅酶A,生成4-甲基戊酸[图2(b)][49]。广藿香酮的生物合成具有时空特异性,主要在幼苗期和7周以下植株的主茎和顶叶中生成,并且发现细胞质中的酰基激活酶基因PcAAE2和Ⅲ型聚酮合酶基因PcPKS3的表达模式与广藿香酮的分布模式具有显著相关性[50]。PcAAE2可以把4-甲基戊酸重新转化为4-甲基戊酰辅酶A,PcPKS3可催化4-甲基戊酰辅酶A和异戊酰辅酶A(推测为广藿香酮B的前体)与丙二酸单酰辅酶A发生反应,但产物不是广藿香酮和广藿香酮B[51]。因此,鉴定广藿香酮生物合成途径中的聚酮合酶是完整解析广藿香挥发油生物合成机制的关键所在。
广藿香(Pogostemonis Herba)为唇形科植物广藿香[Pogostemon cablin (Blanco) Benth.]的干燥地上部分,具有芳香化浊、和中止呕以及发表解暑等功效.挥发油是其芳香化湿的物质基础[44],也是多种中成药的重要药效成分,例如藿香正气口服液等.药理研究表明,广藿香挥发油还具有抗菌、抗炎以及抗肿瘤等作用[45],主要含有倍半萜化合物广藿香醇(patchouli alcohol)和聚酮化合物广藿香酮(pogostone).广藿香醇生物合成机制已被阐明.广藿香醇合酶PcPTS催化EE-FPP生成主产物广藿香醇以及其他13个微量倍半萜化合物[图2(a)],包括β-广藿香烯、(+)-吉马烯A、E-β-石竹烯、α-愈创木烯、西车烯、α-蛇麻烯、α-广藿香烯以及γ-广藿香烯等[46].PcPTS的表达受多个转录因子调控.例如,Chen等[47]发现MYB转录因子家族的PatMYB46可与PatJAZ4结合,显著上调PcPTS的表达;Yu等[48]发现SPL家族的SPL10也可上调PcPTS的表达,从而促进广藿香醇的合成.广藿香酮的生物合成途径目前尚未被完全解析.Wang等[49]采用同位素标记法,证实了4-甲基戊酸是广藿香酮生物合成的前体化合物,并发现PcIBMS1酶在线粒体中可催化4-甲基-2-氧戊酸(4-methyl-2-oxovalerate)和乙酰辅酶A发生aldol缩合,生成2-异丁基苹果酸(2-isobutylmalate),2-异丁基苹果酸通过异构化、脱酸以及与辅酶A相连,生成4-甲基戊酰辅酶A,4-甲基戊酰辅酶A被转运至细胞质,同时失去辅酶A,生成4-甲基戊酸[图2(b)][49].广藿香酮的生物合成具有时空特异性,主要在幼苗期和7周以下植株的主茎和顶叶中生成,并且发现细胞质中的酰基激活酶基因PcAAE2和Ⅲ型聚酮合酶基因PcPKS3的表达模式与广藿香酮的分布模式具有显著相关性[50].PcAAE2可以把4-甲基戊酸重新转化为4-甲基戊酰辅酶A,PcPKS3可催化4-甲基戊酰辅酶A和异戊酰辅酶A(推测为广藿香酮B的前体)与丙二酸单酰辅酶A发生反应,但产物不是广藿香酮和广藿香酮B[51].因此,鉴定广藿香酮生物合成途径中的聚酮合酶是完整解析广藿香挥发油生物合成机制的关键所在. ...
Patchouli oil ameliorates 5-fluorouracil-induced intestinal mucositis in rats via protecting intestinal barrier and regulating water transport
1
2020
... 广藿香(Pogostemonis Herba)为唇形科植物广藿香[Pogostemon cablin (Blanco) Benth.]的干燥地上部分,具有芳香化浊、和中止呕以及发表解暑等功效.挥发油是其芳香化湿的物质基础[44],也是多种中成药的重要药效成分,例如藿香正气口服液等.药理研究表明,广藿香挥发油还具有抗菌、抗炎以及抗肿瘤等作用[45],主要含有倍半萜化合物广藿香醇(patchouli alcohol)和聚酮化合物广藿香酮(pogostone).广藿香醇生物合成机制已被阐明.广藿香醇合酶PcPTS催化EE-FPP生成主产物广藿香醇以及其他13个微量倍半萜化合物[图2(a)],包括β-广藿香烯、(+)-吉马烯A、E-β-石竹烯、α-愈创木烯、西车烯、α-蛇麻烯、α-广藿香烯以及γ-广藿香烯等[46].PcPTS的表达受多个转录因子调控.例如,Chen等[47]发现MYB转录因子家族的PatMYB46可与PatJAZ4结合,显著上调PcPTS的表达;Yu等[48]发现SPL家族的SPL10也可上调PcPTS的表达,从而促进广藿香醇的合成.广藿香酮的生物合成途径目前尚未被完全解析.Wang等[49]采用同位素标记法,证实了4-甲基戊酸是广藿香酮生物合成的前体化合物,并发现PcIBMS1酶在线粒体中可催化4-甲基-2-氧戊酸(4-methyl-2-oxovalerate)和乙酰辅酶A发生aldol缩合,生成2-异丁基苹果酸(2-isobutylmalate),2-异丁基苹果酸通过异构化、脱酸以及与辅酶A相连,生成4-甲基戊酰辅酶A,4-甲基戊酰辅酶A被转运至细胞质,同时失去辅酶A,生成4-甲基戊酸[图2(b)][49].广藿香酮的生物合成具有时空特异性,主要在幼苗期和7周以下植株的主茎和顶叶中生成,并且发现细胞质中的酰基激活酶基因PcAAE2和Ⅲ型聚酮合酶基因PcPKS3的表达模式与广藿香酮的分布模式具有显著相关性[50].PcAAE2可以把4-甲基戊酸重新转化为4-甲基戊酰辅酶A,PcPKS3可催化4-甲基戊酰辅酶A和异戊酰辅酶A(推测为广藿香酮B的前体)与丙二酸单酰辅酶A发生反应,但产物不是广藿香酮和广藿香酮B[51].因此,鉴定广藿香酮生物合成途径中的聚酮合酶是完整解析广藿香挥发油生物合成机制的关键所在. ...
A comprehensive review on pharmacological activities of pachypodol: a bioactive compound of an aromatic medicinal plant Pogostemon cablin Benth
1
2023
... 广藿香(Pogostemonis Herba)为唇形科植物广藿香[Pogostemon cablin (Blanco) Benth.]的干燥地上部分,具有芳香化浊、和中止呕以及发表解暑等功效.挥发油是其芳香化湿的物质基础[44],也是多种中成药的重要药效成分,例如藿香正气口服液等.药理研究表明,广藿香挥发油还具有抗菌、抗炎以及抗肿瘤等作用[45],主要含有倍半萜化合物广藿香醇(patchouli alcohol)和聚酮化合物广藿香酮(pogostone).广藿香醇生物合成机制已被阐明.广藿香醇合酶PcPTS催化EE-FPP生成主产物广藿香醇以及其他13个微量倍半萜化合物[图2(a)],包括β-广藿香烯、(+)-吉马烯A、E-β-石竹烯、α-愈创木烯、西车烯、α-蛇麻烯、α-广藿香烯以及γ-广藿香烯等[46].PcPTS的表达受多个转录因子调控.例如,Chen等[47]发现MYB转录因子家族的PatMYB46可与PatJAZ4结合,显著上调PcPTS的表达;Yu等[48]发现SPL家族的SPL10也可上调PcPTS的表达,从而促进广藿香醇的合成.广藿香酮的生物合成途径目前尚未被完全解析.Wang等[49]采用同位素标记法,证实了4-甲基戊酸是广藿香酮生物合成的前体化合物,并发现PcIBMS1酶在线粒体中可催化4-甲基-2-氧戊酸(4-methyl-2-oxovalerate)和乙酰辅酶A发生aldol缩合,生成2-异丁基苹果酸(2-isobutylmalate),2-异丁基苹果酸通过异构化、脱酸以及与辅酶A相连,生成4-甲基戊酰辅酶A,4-甲基戊酰辅酶A被转运至细胞质,同时失去辅酶A,生成4-甲基戊酸[图2(b)][49].广藿香酮的生物合成具有时空特异性,主要在幼苗期和7周以下植株的主茎和顶叶中生成,并且发现细胞质中的酰基激活酶基因PcAAE2和Ⅲ型聚酮合酶基因PcPKS3的表达模式与广藿香酮的分布模式具有显著相关性[50].PcAAE2可以把4-甲基戊酸重新转化为4-甲基戊酰辅酶A,PcPKS3可催化4-甲基戊酰辅酶A和异戊酰辅酶A(推测为广藿香酮B的前体)与丙二酸单酰辅酶A发生反应,但产物不是广藿香酮和广藿香酮B[51].因此,鉴定广藿香酮生物合成途径中的聚酮合酶是完整解析广藿香挥发油生物合成机制的关键所在. ...
The diverse sesquiterpene profile of patchouli, Pogostemon cablin, is correlated with a limited number of sesquiterpene synthases
1
2006
... 广藿香(Pogostemonis Herba)为唇形科植物广藿香[Pogostemon cablin (Blanco) Benth.]的干燥地上部分,具有芳香化浊、和中止呕以及发表解暑等功效.挥发油是其芳香化湿的物质基础[44],也是多种中成药的重要药效成分,例如藿香正气口服液等.药理研究表明,广藿香挥发油还具有抗菌、抗炎以及抗肿瘤等作用[45],主要含有倍半萜化合物广藿香醇(patchouli alcohol)和聚酮化合物广藿香酮(pogostone).广藿香醇生物合成机制已被阐明.广藿香醇合酶PcPTS催化EE-FPP生成主产物广藿香醇以及其他13个微量倍半萜化合物[图2(a)],包括β-广藿香烯、(+)-吉马烯A、E-β-石竹烯、α-愈创木烯、西车烯、α-蛇麻烯、α-广藿香烯以及γ-广藿香烯等[46].PcPTS的表达受多个转录因子调控.例如,Chen等[47]发现MYB转录因子家族的PatMYB46可与PatJAZ4结合,显著上调PcPTS的表达;Yu等[48]发现SPL家族的SPL10也可上调PcPTS的表达,从而促进广藿香醇的合成.广藿香酮的生物合成途径目前尚未被完全解析.Wang等[49]采用同位素标记法,证实了4-甲基戊酸是广藿香酮生物合成的前体化合物,并发现PcIBMS1酶在线粒体中可催化4-甲基-2-氧戊酸(4-methyl-2-oxovalerate)和乙酰辅酶A发生aldol缩合,生成2-异丁基苹果酸(2-isobutylmalate),2-异丁基苹果酸通过异构化、脱酸以及与辅酶A相连,生成4-甲基戊酰辅酶A,4-甲基戊酰辅酶A被转运至细胞质,同时失去辅酶A,生成4-甲基戊酸[图2(b)][49].广藿香酮的生物合成具有时空特异性,主要在幼苗期和7周以下植株的主茎和顶叶中生成,并且发现细胞质中的酰基激活酶基因PcAAE2和Ⅲ型聚酮合酶基因PcPKS3的表达模式与广藿香酮的分布模式具有显著相关性[50].PcAAE2可以把4-甲基戊酸重新转化为4-甲基戊酰辅酶A,PcPKS3可催化4-甲基戊酰辅酶A和异戊酰辅酶A(推测为广藿香酮B的前体)与丙二酸单酰辅酶A发生反应,但产物不是广藿香酮和广藿香酮B[51].因此,鉴定广藿香酮生物合成途径中的聚酮合酶是完整解析广藿香挥发油生物合成机制的关键所在. ...
PatDREB transcription factor activates patchoulol synthase gene promoter and positively regulates jasmonate-induced patchoulol biosynthesis
1
2022
... 广藿香(Pogostemonis Herba)为唇形科植物广藿香[Pogostemon cablin (Blanco) Benth.]的干燥地上部分,具有芳香化浊、和中止呕以及发表解暑等功效.挥发油是其芳香化湿的物质基础[44],也是多种中成药的重要药效成分,例如藿香正气口服液等.药理研究表明,广藿香挥发油还具有抗菌、抗炎以及抗肿瘤等作用[45],主要含有倍半萜化合物广藿香醇(patchouli alcohol)和聚酮化合物广藿香酮(pogostone).广藿香醇生物合成机制已被阐明.广藿香醇合酶PcPTS催化EE-FPP生成主产物广藿香醇以及其他13个微量倍半萜化合物[图2(a)],包括β-广藿香烯、(+)-吉马烯A、E-β-石竹烯、α-愈创木烯、西车烯、α-蛇麻烯、α-广藿香烯以及γ-广藿香烯等[46].PcPTS的表达受多个转录因子调控.例如,Chen等[47]发现MYB转录因子家族的PatMYB46可与PatJAZ4结合,显著上调PcPTS的表达;Yu等[48]发现SPL家族的SPL10也可上调PcPTS的表达,从而促进广藿香醇的合成.广藿香酮的生物合成途径目前尚未被完全解析.Wang等[49]采用同位素标记法,证实了4-甲基戊酸是广藿香酮生物合成的前体化合物,并发现PcIBMS1酶在线粒体中可催化4-甲基-2-氧戊酸(4-methyl-2-oxovalerate)和乙酰辅酶A发生aldol缩合,生成2-异丁基苹果酸(2-isobutylmalate),2-异丁基苹果酸通过异构化、脱酸以及与辅酶A相连,生成4-甲基戊酰辅酶A,4-甲基戊酰辅酶A被转运至细胞质,同时失去辅酶A,生成4-甲基戊酸[图2(b)][49].广藿香酮的生物合成具有时空特异性,主要在幼苗期和7周以下植株的主茎和顶叶中生成,并且发现细胞质中的酰基激活酶基因PcAAE2和Ⅲ型聚酮合酶基因PcPKS3的表达模式与广藿香酮的分布模式具有显著相关性[50].PcAAE2可以把4-甲基戊酸重新转化为4-甲基戊酰辅酶A,PcPKS3可催化4-甲基戊酰辅酶A和异戊酰辅酶A(推测为广藿香酮B的前体)与丙二酸单酰辅酶A发生反应,但产物不是广藿香酮和广藿香酮B[51].因此,鉴定广藿香酮生物合成途径中的聚酮合酶是完整解析广藿香挥发油生物合成机制的关键所在. ...
Progressive regulation of sesquiterpene biosynthesis in Arabidopsis and Patchouli (Pogostemon cablin) by the miR156-targeted SPL transcription factors
1
2015
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Synthesis of 4-methylvaleric acid, a precursor of pogostone, involves a 2-isobutylmalate synthase related to 2-isopropylmalate synthase of leucine biosynthesis
2
2022
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